研究员、硕士导师

基本情况

出生年月：1992.05

最高学位：理学博士

工作单位：深圳华大生命科学研究院

工作地址：广东省深圳市盐田区梅沙街道云华路9号华大时空中心

Email:liuchuanyu@genomics.cn

教育及工作经历

2024.04–至今      深圳华大生命科学研究院，分院院长/研究员

2023.03–2024.04    深圳华大生命科学研究院，研究所所长/副研究员

2022.06–2023.02    深圳华大生命科学研究院，研究所副所长/副研究员

2021.07– 2022.05   深圳华大生命科学研究院，项目负责人

2019.07– 2021.06   深圳华大生命科学研究院，基因组学专业，博士后

2014.09 – 2019.06    中国科学院大学，基因组学专业，理学博士

2010.09 – 2014.06    安徽医科大学，生物技术专业，本科

学术兼职

中国标准化协会卫生健康专业委员会委员、中国老年医学学会智慧医疗技术与管理分会委员、“血液生态十亿细胞多组学计划”（HEMO ABC）专家委员会委员

研究领域及主要成果

研究领域：细胞组学测序技术及细胞病理应用研究

主要成果：单细胞多维组学技术scCAT-seq（Nat. Commun., 2019），HT-scCAT-seq（Genome Biology，2025），基于DNA纳米球的细胞组学技术Stereo-cell（Science, 2025），人类全能干细胞8CLC体外诱导（Nature, 2022a），非人灵长类动物单细胞转录组图谱绘制（Nature, 2022b），中国人群免疫多组学图谱CIMA（Science, 2026）。

近年来在Science, Nature, Nat. Commun., Cell Reports，Genome Biology等杂志发表论文67篇，其中第一作者或通讯作者32篇。申请国际发明专利22项（授权4项），中国发明专利18项（授权6项），软著7项。

主持科研项目

1. 国家科技部，国家重点研发计划-前沿生物技术，大规模细胞多模态多组学数据集构建(2025YFC3409302,，课题)，2025/9-2028/8,1200万元，在研，主持

2. 深圳市创新创业专项，深圳市数字化细胞病理概念验证中心(深科创资〔2024〕59号)，2022/1-2026/12，300万元，在研，主持

3. 中国博士后科学基金一等资助,基于单细胞多组学测序技术的新冠肺炎患者免疫细胞异质性响应研究(2020T130080ZX), 2020/08-2021/05, 18万元,结题,主持

4. 分子发育生物学国家重点实验室，开放课题，下丘脑空间转录组图谱的绘制，2022/01-2022/12, 8万元,结题,主持

获奖情况

深圳市高层次人才、深圳市盐田区梧桐人才

代表性论文、专著和专利等（不超过10项）

1. Jianhua Yin#, Yuhui Zheng#, Zhuoli Huang#, Wenwen Zhou#, Yue Yuan#, Pengfei Cai#, Yong Bai#, Shichen Yang, Yue Gao, Shanshan Duan, Yang Wang, Zekai Xu, Wenxi Zhang, Xinyu Zhang, Yilin Wei, Yaling Huang, Ying Liu, Weikai Wang, Tao Yang, Zhongjin Zhang, Xiaoya Chen, Xiru Zhang, Jingzhi Lv, Fupeng Li, Yan Zhang, Guodan Zeng, Xue Wang, Wen Ma, Guixue Hou, Shijie Hao, Chang Liu, Yiwei Lai, Bo Wang, Yuxiang Li, Wenwei Zhang, Peng Gao, Jun Xie, Miguel A. Esteban, Ying Gu, Jiansong Ji, Ting Qi, Boxiang Liu, Hua Wang, Yi Zhao, Xiao Yang, Xiangdong Wang, Runsheng Chen, Jian Yang, Ye Yin, Jian Wang, Yanan Cao*, Xun Xu*, Longqi Liu*, Xin Jin*,Chuanyu Liu*. Chinese Immune Multi-Omics Atlas. Science (in press), 2025. (*通讯作者)

2. Sha Liao#, Xiaoxi Zhou#, Chuanyu Liu#, Chang Liu#, Shijie Hao#, Hongyu Luo#, Huan Hou, Qian Liu, Zhe Zhang, Liyun Xiao, Yuan Xu, Yaling Huang, Sining Zhou, Xuerong Li, Yang Wang, Lulin Xie, Zhichun Zhou, Shichen Dong, Yiru Wang, Xiaojing Xu, Pengcheng Guo, Xiumei Lin, Jiajie Lei, Qiaoling Wang, Yuxin Gong, Jiaming Cheng, Zixin Yuan, Yongqing Yang, Zhi Huang, Shenglong Li, Yuhui Zheng, Shichen Yang, Xin Huang, Weiqing Liu, Mei Li, Zhonghan Deng, Xinyu Yang, Jianhua Yin, Yingjie Luo, Yiwei Lai, Yue Yuan, Mengnan Cheng, Bo Wang, Jiansong Ji, Miguel A. Esteban, Yuxiang Li, Ying Gu, Yijun Ruan, Liang Chen, Xiangdong Wang, Jun Xie, Jian Wang, Longqi Liu*, Ao Chen*, Xun Xu*. Stereo-cell: spatial enhanced resolution single-cell sequencing with high-density DNA nanoball-patterned arrays. Science 2025,389(6762):eadr0475. (#第一作者)

3. Qiuting Deng#, Pengfei Cai#, Yingjie Luo#, Zhongjin Zhang#, Wen Ma, Zijie Huang, Xiaoya Chen, Shijie Hao, Weiguang Ma, Jiangshan Xu, Chunqing Wang, Mengnan Cheng, Xiumei Lin, Ru Zhou, Shanshan Duan, Junjie Chen, Ronghai Li, Xuyang Shi, Chang Liu, Liang Wu, Peng Gao, Jianting Li, Xiao Yang, Xiangdong Wang, Jun Xie, Longqi Liu*, Yue Yuan*, Chuanyu Liu*. Deciphering gene regulatory programs in mouse embryonic skin through single-cell multiomics analysis. Genome Biology 2025, 26(1): 187.(*通讯作者)

4. Lei Han#, Xiaoyu Wei#, Chuanyu Liu#, Giacomo Volpe#, Zhenkun Zhuang#, Xuanxuan Zou#, Zhifeng Wang#, Taotao Pan, Yue Yuan, Xiao Zhang, Peng Fan, Pengcheng Guo, Yiwei Lai, Ying Lei, Xingyuan Liu, Feng Yu, Shuncheng Shangguan, Guangyao Lai, Qiuting Deng, Ya Liu, Liang Wu, Quan Shi, Hao Yu, Yunting Huang, Mengnan Cheng, Jiangshan Xu, Yang Liu, Mingyue Wang, Chunqing Wang, Yuanhang Zhang, Duo Xie, Yunzhi Yang, Yeya Yu, Huiwen Zheng, Yanrong Wei, Fubaoqian Huang, Junjie Lei, Waidong Huang, Zhiyong Zhu, Haorong Lu, Bo Wang, Xiaofeng Wei, Fengzhen Chen, Tao Yang, Wensi Du, Jing Chen, Shibo Xu, Juan An, Carl Ward, Zongren Wang, Zhong Pei, Chi-Wai Wong, Xiaolei Liu, Huafeng Zhang, Mingyuan Liu, Baoming Qin, Axel Schambach, Joan Isern, Liqiang Feng, Yan Liu, Xiangyu Guo, Zhen Liu, Qiang Sun, Patrick H Maxwell, Nick Barker, Pura Muñoz-Cánoves, Ying Gu, Jan Mulder, Mathias Uhlen, Tao Tan, Shiping Liu, Huanming Yang, Jian Wang, Yong Hou*, Xun Xu*, Miguel A Esteban*, Longqi Liu*. Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis. Nature 2022, 604: 723-731. (#第一作者)

5. Md Abdul Mazid#*, Carl Ward#, Zhiwei Luo#, Chuanyu Liu#, Yunpan Li, Yiwei Lai, Liang Wu, Jinxiu Li, Wenqi Jia, Yu Jiang, Hao Liu, Lixin Fu, Yueli Yang, David P Ibañez, Junjian Lai, Xiaoyu Wei, Juan An, Pengcheng Guo, Yue Yuan, Qiuting Deng, Yang Wang, Ying Liu, Fei Gao, Junwen Wang, Shahriar Zaman, Baoming Qin, Guangming Wu, Patrick H Maxwell, Xun Xu, Longqi Liu*, Wenjuan Li*, Miguel A Esteban*. Rolling back human pluripotent stem cells to an eight-cell embryo-like stage. Nature 2022, 605: 315-324. (#第一作者)

6. Longqi Liu#, Chuanyu Liu#, Andrés Quintero#, Liang Wu#, Yue Yuan#, Mingyue Wang, Mengnan Cheng, Lizhi Leng, Liqin Xu, Guoyi Dong, Rui Li, Yang Liu, Xiaoyu Wei, Jiangshan Xu, Xiaowei Chen, Haorong Lu, Dongsheng Chen, Quanlei Wang, Qing Zhou, Xinxin Lin, Guibo Li, Shiping Liu, Qi Wang, Hongru Wang, J Lynn Fink, Zhengliang Gao, Xin Liu, Yong Hou, Shida Zhu, Huanming Yang, Yunming Ye, Ge Lin, Fang Chen, Carl Herrmann, Roland Eils*, Zhouchun Shang*, Xun Xu*. Deconvolution of single-cell multi-omics layers reveals regulatory heterogeneity. Nat. Commun. 2019, 10: 470. (#第一作者)

7. 刘传宇;刘龙奇;黄亚灵;袁月;王明月;魏小雨;王姗姗;王春青，基于液滴微流控的单细胞测序及应用（ZL202080091329.7），授权日期2025/03/04，发明专利，中国

8. 刘传宇;刘龙奇;黄亚灵;袁月;王明月;魏小雨;王姗姗;王春青，基於液滴微流控的單細胞測序及應用（HK40070111），授权日期2025/8/29，发明专利，中国香港

9. Longqi Liu; Chuanyu Liu; Liang Wu; Zhouchun Shang; Mengnan Cheng; Yue Yuan; Jiangshan Xu; Xin Liu; Xun Xu，METHOD FOR CONSTRUCTING SINGLE CELL SEQUENCING LIBRARY AND USE THEREOF（US11434483B2），授权日期2022/09/06，发明专利，美国

10. Mingyue Wang;Longqi Liu;Chuanyu Liu;Liang Wu;Jiangshan Xu;Yue Yuan;Zhouchun Shang，METHOD FOR CONSTRUCTING LIBRARY OF CELL-FREE DNAS IN BODY FLUIDS AND APPLICATION THEREOF（US12104203B2），授权日期2024/10/01，发明专利，美国