副研究员、硕士导师

基本情况

出生年月：1987.01

最高学位：神经生物学博士

工作单位：深圳华大生命科学研究院

工作地址：广东深圳市盐田区云华路9号华大时空中心

Email:liuchang4@genomics.cn

教育及工作经历

2020.05– 至今      华大生命科学研究院，副研究员

2017.11 – 2020.04   武汉大学附属人民医院，助理研究员

2015.09 – 2017.08     华中农业大学，细胞生物学专业，博士后

2009.09 – 2015.06     中国科学院大学，神经生物学专业，理学硕士

2005.09 – 2009.06     华中科技大学，生物信息技术专业，本科

学术兼职

华中农业大学、山西医科大学兼职教授

研究领域及主要成果

主要研究方向为细胞组学技术开发以及胚胎发育和疾病的多组学研究。曾主导包括国自然青年基金在内的2项科研项目，近5年以第一及通讯作者（含共同）发表在Science，PNAS，Developmental Cell，Nature Communications等期刊，申请组学技术专利软著6项，获批软著6项。在技术开发方向，作为主要负责人之一参与基于DNB芯片的细胞测序技术、基于单分子长度长测序的单细胞全长测序技术的开发。在科学研究方面，代表性成果为利用Stereo-seq测序技术绘制了斑马鱼胚胎早期发育的时空图谱。

主持科研项目

1、2018. 1–2019.12 中央高校基本科研业务费专项资金青年教师资助基金项目

• 2042018kf0083，RECS1在急性肺损伤中的作用及其机制研究，6万，已结题。

2、2017. 1–2019.12 国家自然科学基金青年科学基金项目

• 31601181，基于Single Cell RNA-seq 的斑马鱼神经干细胞不对称分裂调控机制研究，20万，已结题。

获奖情况

深圳市高层次人才，盐田区梧桐人才

代表性论文、专著和专利等（不超过10项）

1. Sha Liao*, Xiaoxi Zhou*, Chuanyu Liu*,Chang Liu*,Shijie Hao*, Hongyu Luo*,...,Longqi Liu#, Ao Chen# & Xun Xu#, Stereo-cell: spatial enhanced resolution single-cell sequencing with high-density DNA nanoball-patterned arrays, Science.2025Aug 21;389(6762):eadr0475.（共同第一作者）.

2. Fangbin Chen*, Yue Zhang*, Xiaoming Wang*, Zhaohua Deng*,...,Pengfei Pang#, Wei Ge#, Chang Liu#,Hong Shan# and Huanhuan He#,DDX24 spatiotemporally orchestrates VEGF and Wnt signaling during developmental angiogenesis, PNAS.2025,122 (19) e2417445122（共同通讯作者）.

3. Chang Liu, Xuerong Li, Qinan Hu, Zihan Jia, Qing Ye, Xianzhe Wang, Kaichen Zhao, Longqi Liu#, Mingyue Wang#, Decoding the blueprints of embryo development with single-cell and spatial omics, Semin Cell Dev Biol.2025 Mar;167:22-39（第一作者）.

4. Jie Zhou, Xueqian Yang, Xiumei Lin, Kaichen Zhao, Xue Wang, Zhiqiang Dong, Chuanyu Liu#, and Chang Liu#,Protocol to profile snATAC-seq datasets and motif enrichment analysis during zebrafish early embryogenesis, STARProtocols.2024 Dec 12; 5(4): 103501 （最后通讯作者）.

5. Xiumei Lin*, Xueqian Yang*, Chuan Chen*, ..., Zhiqiang Dong#, Chuanyu Liu#, Longqi Liu#, Chang Liu#, Single-nucleus chromatin landscapes during zebrafish early embryogenesis,Scientific Data.2023,10: 464 （最后通讯作者）.

6. Chang Liu*, Rui Li*, Young Li*, ..., Xun Xu#, Zhiqiang Dong#, Longqi Liu#, Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafifish embryogenesis, Developmental Cell. 2022, 57: 1284–1298 （第一作者）.

7. 黎雪蓉，刘畅，林秀妹，刘传宇，罗焜月，宋雨默，刘龙奇，基于液滴的PCR扩增、建库及测序方法，2023-12-28，美国，PCT/CN2023/139573（专利）

8. 王雪，林秀妹，刘畅，陈亮，周洁，刘传宇，刘龙奇，转录本异构体转换事件识别方法、装置、设备和存储器，2024-11-8，中国，2024115911152（专利）

9. 王雪，林秀妹，刘畅，陈亮，刘传宇，刘龙奇，识别单细胞全长转录本异构体转换事件的软件V1.0，中国，2024SR1724537（软著）

10. 王雪，林秀妹，刘畅，刘传宇，刘龙奇，基于机器学习自动注释scATAC-seq细胞群体的软件，中国，2024SR1193384（软著）