副研究员、硕士导师

基本情况

出生年月：1989.02

最高学位：哲学博士

工作单位：华大生命科学研究院

工作地址：广东省深圳市盐田区云华路9号华大时空中心

Email:ouzhihua@genomics.cn;gina07662011@hotmail.com

教育及工作经历

2018.07 – 至今,华大生命科学研究院，生物信息副研究员

2012.11 – 2013.08, 香港大学公共卫生学院,研究助理

2012.07 – 2012.10, 汕头大学国际感染与免疫研究中心，技术员

2013.09 – 2018.12, 香港大学,公共卫生学院，病毒学专业，哲学博士

2008.09 – 2012.06, 中山大学，生命科学学院，生物技术专业，理学学士

学术兼职

无

研究领域及主要成果

感染与免疫；生物信息学；多组学大数据

1）基于HPV全基因组测序技术，开发了对应的病毒基因组组装及谱系鉴定流程；2）揭示了四种高危型别HPV（16、18、52、58）在中国中部和南部女性群体中的谱系流行趋势；3）参与开发了新冠病毒多重扩增子测序技术，并将其应用于病毒载量极低的复阳患者咽拭子样品中，揭示了复阳患者二次感染的病毒来源；4）利用单细胞转录组技术，基于病毒受体表达谱对多种病毒的物种、组织及细胞类型嗜性进行了评估，提出了联合蛋白结构相似性及基因表达谱等多组学数据开展病毒宿主谱筛查的理论框架，并参与建立了开放数据库VThunter，为人兽共患病毒的细胞嗜性筛查提供了数据资源；5）联合使用单核转录组及空间转录组技术对HPV感染的宫颈癌组织开展转录图谱研究，阐述了肌成纤维细胞在宫颈鳞癌进展中的促进作用，揭示了宫颈鳞癌中病毒基因表达和免疫应答状态的空间异质性，为疾病预后及治疗提供科学参考；6）利用时空组学技术，解析了泡型包虫病、乙型脑炎、长新冠相关的宿主免疫应答分子机制，为疾病诊治提供了理论参考。

主持科研项目

无

获奖情况

2022 深圳华大生命科学研究院2021年度个人价值贡献奖

2019 深圳市海外高层次人才C类

2019 深圳市盐田区“梧桐人才”C类

2015 香港大学研究成果奖（集体）

2013 香港政府博士奖学金（2013-2017）

代表性论文、专著和专利等（不超过10项）

1. Ou, Z., Wang, Z., Chen, Q., Ren, P., He, X., Liang, Y., Liang, Y., Wang, J., Liao, S., Wang, D., et al. (2025). Spatial transcriptomics elucidates the central role of cerebral vasculatures in the progression of Japanese encephalitis. BioRxiv Preprint. (预印，第一一作)

2. Ou, Z., Li, L., Ren, P., Zhou, T., He, F., Chen, J., Cai, H., Han, X., Wu, Y., Li, J., et al. (2025). Spatiotemporal Transcriptomic Profiling Reveals the Dynamic Immunological Landscape of Alveolar Echinococcosis. Advanced Science, 2405914. (第一一作)

3. Ou Z., Yin J., Wu L., Ginhoux F., Jin X. (2023). Spatial transcriptomics in cancer research: Opportunities and challenges. The Innovation Life 1(1), 100006. (第一一作)

4. Ou, Z., Lin, S., Qiu, J., Ding, W., Ren, P., Chen, D., Wang, J., Tong, Y., Wu, D., Chen, A., et al. (2022). Single‐Nucleus RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal the Immunological Microenvironment of Cervical Squamous Cell Carcinoma. Advanced Science 2203040. (第一一作)

5. Chen, D., Ou, Z., Zhu, J., Wang, H., Ding, P., Luo, L., Ding, X., Sun, C., Lan, T., Sahu, S. K., Wu, W., Yuan, Y., Wu, W., Qiu, J., Zhu, Y., Yue, Q., Jia, Y., Wei, Y., Qin, Q., … Liu, H. (2022). Screening of cell‐virus, cell‐cell, gene‐gene crosstalk among animal kingdom at single cell resolution. Clinical and Translational Medicine, 12(8). (共同一作)

6. Zu, Y., Ou, Z., Wu, D., Liu, W., Liu, L., Wu, D., Zhao, Y., Ren, P., Zhang, Y., Li, W., et al. (2021). Genetic characteristics of human papillomavirus type 16, 18, 52 and 58 in southern China. Genomics 113, 3895–3906. (共同一作)

7. Ou, Z., Chen, Z., Zhao, Y., Lu, H., Liu, W., Li, W., Ren, P., Geng, C., Xiao, M., Hu, G., et al. (2021). Genetic signatures for lineage/sublineage classification of HPV16, 18, 52 and 58 variants. Virology 553, 62–69. (一作)

8. Hu, F., Chen, F., Ou, Z., Fan, Q., Tan, X., Wang, Y., Pan, Y., Ke, B., Li, L., Guan, Y., et al. (2020). A compromised specific humoral immune response against the SARS-CoV-2 receptor-binding domain is related to viral persistence and periodic shedding in the gastrointestinal tract. Cell Mol Immunol. (共同一作)

9. Ou, Z., Ouzounis, C., Wang, D., Sun, W., Li, J., Chen, W., Marlière, P., and Danchin, A. (2020). A path towards SARS-CoV-2 attenuation: metabolic pressure on CTP synthesis rules the virus evolution. Genome Biology and Evolution. (一作)

10. Lam, T.T.-Y., Wang, J., Shen, Y., Zhou, B., Duan, L., Cheung, C.-L., Ma, C., Lycett, S.J., Leung, C.Y.-H., Chen, X., et al. (2013). The genesis and source of the H7N9 influenza viruses causing human infections in China. Nature 502, 241–244. (参与)